（记者 李天舒）如果把整个医药产销链条比作河流的话，基本药物制度不仅涉及上游的遴选、生产环节，也涉及中游的流通、定价环节和下游的使用、报销、监测评价等环节，这为彻底治理药价“水系污染”带来了希望。
　　上游：降价药“死去活来”痼疾要根治
　　基本药物制度的设计，要从源头挤掉水分。那么，基本药物制度试行后，国家从定价和统一招标采购两手，直接影响上游，一些制药企业将会退出市场。在制药企业与地方GDP紧密结合的情况下，如何对待这些因挤干药价水分而退市的药企呢？
　　有人大代表担忧，在药品目录的遴选过程中，会不会掺杂着复杂的利益关系？同时，药品生产厂家是否会因为没有利润被吓跑？这些都是现实的难题。
　　中游：目录过窄问题需想法解决
基本药物制度中的药品目录制定，虽允许各地有一定的增补比例，避免了全国“一刀切”，但这似乎还不够。
　　目录过窄也引起社会关注。拿河南省来说，基本药物制度启动后，该省401个乡镇卫生院和153个社区卫生服务中心全部配备307种基本药物。同时，根据各省可根据本地情况选择200种药物作为基本药物补充，并实行零差价销售的规定，郑州市选择了200种药物作为基本药物的补充。
但是，即便是507种基本用药，也不能满足群众看病需求。据调查，一个卫生院目前正在使用的药品有1200多种，除去这507种基本用药之外，剩余的700多种药品将在两个月过渡期结束后，从卫生院消失。而在省级医院，基本药物只占临床用药比例的1/6甚至更低。
　　下游：补偿到位方能防“挤出”效应

　　随着基本药物制度的实施，作为承担老百姓看病就医和公共卫生服务的三级网网底，乡村医生出路堪忧。 　

　　事实上，基本药物制度实施后，受影响最大的还是基层医疗卫生机构。在改变以药养医的生存现状后，基层医疗卫生机构取消药品加成后减少的收入仅由财政一家补偿，尤其是地方财政来负担，引起人大代表对地方财政补偿能力的担忧。