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（一）推进医药卫生体制改革，拟订卫生改革与发展战略目标、规划和相关政策，起草卫生、食品安全、药品、医疗器械等地方性法规、规章草案，依法制定有关地方性标准和技术规范，并监督实施。
（二）负责组织实施国家基本药物制度，贯彻国家基本药物目录，拟订执行基本药物的相关政策，制定基本药物采购、配送、使用的有关规定，提出我省基本药物价格政策的建议；负责药械集中采购的具体组织实施与监督管理。
（三）负责食品安全综合协调，组织查处食品安全重大事故，组织制定地方性食品安全标准，建立并实施食品安全风险评估和预警制度，统一发布全省重大食品安全信息。
（四）统筹规划、协调全省卫生资源配置，指导区域卫生规划的编制和实施。
（五）组织制定农村卫生和城市社区卫生服务发展规划和政策措施，指导并推进基层卫生服务体系建设。
（六）组织制定新型农村合作医疗政策制度，负责新型农村合作医疗的综合管理。
（七）制定妇幼卫生发展规划和政策措施，负责妇幼保健的综合管理和监督，组织对开展生殖健康和计划生育技术服务的医疗保健机构进行监督、管理和指导。
（八）负责疾病预防控制工作，制定并实施重大疾病防治规划与策略，执行国家免疫规划及政策措施，协调有关部门对重大疾病实施防控和干预，发布法定报告传染病疫情信息。
（九）组织拟订基本公共卫生服务均等化政策措施，制定并指导实施基本和重大公共卫生服务项目制度，协调推进基本公共卫生服务均等化工作。
（十）负责卫生应急工作，制定卫生应急预案和政策措施，负责突发公共卫生事件监测预警和风险评估，指导实施突发公共卫生事件预防控制与应急处置，发布突发公共卫生事件应急处置信息。
（十一）组织制定中医药、民族医药发展规划，并纳入卫生事业总体发展规划，负责中医药的继承、创新和中西医结合工作，统筹协调中西医发展。
（十二）指导规范卫生行政执法工作，依法负责职业卫生的监督管理；按照职责分工负责放射卫生、环境卫生和学校卫生的监督管理，负责公共场所和饮用水的卫生安全监督管理，负责传染病防治监督。
（十三）组织拟订公立医院改革政策措施，指导和监督公立医院建立科学的管理体制、运行机制和监管机制，组织拟订社会资本参与医疗卫生事业发展政策措施，指导和监督民营医疗机构健康规范发展。
（十四）负责医疗机构医疗服务的全行业监督管理，制定医疗机构医疗服务、技术、医疗质量和采供血机构管理的政策、规范、标准，实施医疗机构和从业人员执业许可制度，组织制定医疗卫生职业道德规范，建立医疗机构医疗服务评价和监督体系。
（十五）组织制定医药卫生科技发展规划，组织实施医药卫生科学研究，参与制定医学教育发展规划，指导推进医学科技成果转化和推广应用，组织开展继续医学教育、全科医学教育和毕业后医学教育工作。
（十六）指导卫生人才队伍建设工作，组织拟订卫生人才发展规划。
（十七）组织实施卫生方面的国际交流合作与卫生援外有关工作，开展与港澳台的卫生合作工作。
（十八）负责来浙中央领导和重要外宾的医疗保健工作，负责省保健委员会确定的保健对象的医疗保健工作，负责国家和省重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
（十九）负责管理省级卫生事业单位。承担省爱国卫生运动委员会、省公共卫生委员会的具体工作。
（二十）承办省政府交办的其他事项。
目前，省卫生厅设有18个处室：
办公室
政策法规处
规划财务与审计处
公共卫生应急处理办公室（挂突发公共卫生事件应急指挥中心牌子）
疾病预防控制处（挂省爱国卫生运动委员会办公室牌子）
农村卫生管理处
妇幼保健与社区卫生处（挂计划生育技术指导处牌子）
医政处
食品安全协调监察处
卫生监督局
药械采购管理处
科技教育处
国际合作处（挂港澳台办公室牌子）
省保健委员会办公室（挂保健局牌子）
人事处
离退休干部处
直属机关党委
派驻纪检组、监察室 | 
